近日,华大在深圳国家基因库正式对外发布一项迄今为止最大规模的中国人基因组学大数据研究成果。
这是由中国科学家主导,历时两年,对14余万中国人的无创产前基因检测数据进行深入研究后,首次揭秘中国人群基因遗传特征的科研成果,也是由华大主导的“百万人群基因大数据研究”项目的首秀。
对此,华大生命科学研究院院长、文章第一通讯作者徐讯博士表示,本次研究成果有两个重要意义,首先,这标志着生命科学产业已经从单个样本的检测和诊断,正式进入了基因大数据时代;其次,也验证了基于大人群的精准医学研究已成为新的科研模式,对基因组学大数据研究具有开创性价值。
据了解,华大在2016年正式发起“百万人群基因大数据研究”项目,此次研究项目正是其第一期的成果。
南北方6大遗传差异
在本次研究中,华大的研究小组成功构建了包含904万个多态性位点在内的中国人基因频率数据库(CMDB),其中约有20万个多态性位点属于首次发现,这是目前正式发表的最大规模的中国人群基因频率数据库。
值得一提的是,研究小组确定了6个在地区纬度方向上受到强烈自然选择的基因,它们在基因频率上呈现明显的南北差异,充分展现了饮食、气候、病原体等环境因素对中国人群的演化所起到的选择作用。
比如,由于古代在北方、西北等地区如新疆、青海和内蒙古等地可能由于蔬菜获取比较困难,导致生活在这些地区的人们肉类摄入比例较大,因此,促进脂肪代谢率的等位基因在这些地区有明显富集的趋势。
与机体免疫功能相关的编码红细胞补体受体I的基因CR1呈现了南方富集的现象。古代中国南方被称为南蛮瘴气之地,自然环境恶劣,病原微生物尤其是疟疾盛行,因此对于生存于该地区的人在免疫力方面有较高的要求。
北方体味小
此外,与耳垢干湿、体味(如狐臭)、大汗腺分泌等相关的ABCC11基因,也呈现了明显的南北方选择差异。除了部分广西、广东和海南的中国人没有这个基因突变之外,绝大部分的生活在北方温带气候地区的人们都有这个基因突变,突变结果表现为干性耳垢、体味较小、大汗腺分泌较少,这样可能更有利于北方的生存环境。而在南方,则没有这方面的自然选择压力,从而使野生型基因在南方长久地流传下来。
甘肃以及靠近甘肃省的宁夏和青海省有较高的欧洲血统
研究小组通过分析人群遗传距离的变化和基因流方向,揭示了汉族与少数民族群体的遗传结构特点及中国各省与欧洲、南亚、东亚人群的基因交流程度(或者说是通婚程度),发现当今中国人的遗传特点同时受到丝绸之路及近代人口大规模迁徙等因素的多重影响。
本次研究发现,甘肃以及靠近甘肃省的宁夏和青海省的汉族人群体中所含有的欧洲人成分高于其它省份,为全国平均水平的1.7倍,达到0.115%。这个地区在古代恰巧是丝绸之路的必经之地——河西走廊的所在之处,是中西方人群汇聚的地方,很可能由此导致该地区汉族人有较高的欧洲血统。
首次发现“怀双胞胎”基因
通过数据分析,研究小组一次性发现并且验证了48个与身高以及13个与BMI显著相关的基因位点,包括这些位点在内的常见突变位点分别解释了48%的身高遗传率以及10%的BMI遗传率。
随着研究的进一步深入,科学家和算法工程师有可能可以利用这些信息构建适合于中国人的身高预测模型,通过基因数据推断个人的身高情况。
另外,研究小组对怀孕年龄和双胎怀孕两个表型进行了深入分析,发现了两个与怀孕年龄显著相关的基因位点,暗示着这两个位点的突变与生育力密切关联; 与此同时,还在NRG1基因中发现了一个和双胞胎妊娠显著相关的突变位点,也就是说携带NRG1基因的突变,有更高的几率怀上双胞胎。
首次揭示中国人病毒图谱:乙肝病毒排首位
华大的研究小组还首次全面揭示了全国31个省级行政单位的人群病毒感染发生率以及病毒在血浆中丰度的分布。
研究发现,中国人血浆的病毒组与欧洲人存在比较大的差异,比如,在欧洲人群中排名前两位的分别是与皮肤急疹相关的疱疹病毒7型及与鼻咽癌相关的疱疹病毒4型,而在我国人群中排在首位的则是乙肝病毒,其感染发生率大约为2.5%。
狐臭遗传
狐臭病,俗称腋臭或狐臭,学名臭汗症。魏晋南北朝时期的“五胡乱华”,是狐臭或曰“胡臭”在中国人中间传播的开始。
狐臭,是分布在体表皮肤如腋下、会阴、背上部位的大汗腺分泌物中产生散发出的一种特殊难闻的气味,一般多发生在青春期,到老年时逐渐减轻或消失。狐臭病的发病率随个体和卫生习惯的不同而有差异,其程度随季节和天气的不同有所变化,比如南方患者就比北方患者患上狐臭的多。
狐臭是常见的临床的一种疾病,狐臭是由于受青少年时期内分泌的影响,腋下大汗腺(又名顶泌腺)分泌出的脂肪酸、蛋白质等物质,被细菌酵解而产生的不饱和脂肪酸发出的一种气味。汗液中的几种可以引起臭味的成分,对这些成分进一步研究发现,细菌酶才是罪魁祸首。
至少有8种磺胺醇类物质与汗臭味有关。即使在很低的浓度下这些物质也能释放出强烈的臭味。但是这些能释放出臭味的物质并不是由汗腺直接分泌出来的,而是由腋窝中的细菌降解了汗液中的一些化学成分后形成的,汗液本身则是没有味道的。
医学研究认为,狐臭是一种常染色体显性单基因遗传病,其基因是X染色体上的显性基因,具有清晰的遗传规律。根据染色体的遗传规律,我们来看一看此病的遗传规律。为了便于理解,我们用A表示携带者携带的狐臭显性基因,用a表示正常基因。即携带者携带的狐臭显性基因为XA,正常基因为Xa。
家族没有狐臭遗传史,为什么偏偏自己有狐臭?狐臭的发生有先天因素和后天因素,如果没有家族遗传史,则为后天因素造成的。
狐臭后天形成因素有哪些?
① 饮食习惯引起
南方人偏好进食辛辣类食物,而辛辣、刺激性食物容易诱发狐臭。这也是南方发生狐臭几率比北方高的原因。
② 卫生习惯引起
狐臭根源在于大汗腺分泌物,而细菌增生会增加分泌物,加重狐臭。因此平时因注重个人卫生,勤洗澡,勤换衣物,保持皮肤洁净干燥,以减少细菌滋生。
③ 内分泌失衡引起
长期精神压力大、作息不规律等不良生活状态,都会导致内分泌出现失衡状态,影响大汗腺分泌,诱发狐臭发生。
④ 刺激汗腺引起
频繁刮、拔、剃腋毛,或腋毛去除方式不当,会破坏腋下皮肤正常结构,引发狐臭。
后天性狐臭与生活习惯有关,那后天性狐臭会遗传吗?
后天性狐臭患者,大汗腺已发生异常,患狐臭后怀孕生产,孩子的大汗腺状态基本继承父母,父母大汗腺不稳定,孩子患狐臭的几率提高。遗传学研究已经证明,狐臭属于常染色体显性遗传病,父母双方都患有狐臭的情况下,子女患病几率高达80%。父母单方异味,子女仍然有50%的几率患病。目前医学界无法阻止遗传性狐臭的发生,但父母大汗腺恢复正常且处于长期稳定状态,可在一定程度上降低遗传几率。为了孩子健康成长,应该尽早使用奇记净味干预调理大汗腺。
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